Diese virtuelle 9. Staffel knüpft direkt an die finale Doppelfolge 'The Truth' an und erzählt, wie es mit den Agenten und den X-Akten hätte weiter gehen können.

Während Mulder und Scully versuchen, sich ein normales Familienleben aufzubauen, geraten Kersh und Doggett aneinander. Kersh will Doggett dazu bringen, die X-Akten aufzugeben, doch dieser stellt sich quer. Als Skinner und Reyes den neuen Assistant Director Follmer vor die Nase gesetzt bekommen, wird Skinner mißtrauisch. Er sucht bei Scully Rat und entdeckt etwas sehr Eigenartiges...

Plötzlich werden Menschen aggressiv, sind vom Pech verfolgt und handeln völlig wider ihrer Natur. Und immer scheint es, als ob ein Fremder der Auslöser ist. Doch der ist immer spurlos verschwunden, wenn alles vorbei ist. Als er in einer Spielbank einen Geldautomaten nach dem anderen ausnimmt, werden die örtlichen Behörden wieder auf ihn aufmerksam. Doggett und Reyes beginnen zu ermitteln und stoßen dabei auf einen fahrenden Händler, der vom Amulett der Primigenia erzählt...

Während Scully sich immer häufiger mit Seth Masters, einem alten Studienkollegen trifft, stellt Doggett Nachforschungen über dessen Person an. Mulder und Reyes verschlägt es indes in ein seltsames, ihnen bisher völlig unbekanntes Dorf im Bundesstaat Texas. Ein Mann ist dort des Nachts unter mysteriösen Umständen ums Leben gekommen. Da sich die Ermittlungen hinziehen, bleiben die Agenten, wenn auch nur ungern, über Nacht in einem der Häuser - nicht ahnend, dass dies erst der Beginn eines unglaublichen Falles ist!